Марат Шемиунов завершил обучение в Академии русского балета имени А. Я. Вагановой в 2001 году и в том же году стал частью труппы Михайловского театра. В 2007 году он получил номинацию на Высшую петербургскую театральную премию «Золотой софит» в категории «Лучшая мужская роль в балете» за исполнение партии Жана де Бриена в балете «Раймонда». Критики отмечают его артистичность и харизму, подчеркивая, что Шемиунов является чутким и интеллектуальным исполнителем, способным глубоко понять художественную задачу и сосредоточиться на роли. В настоящее время Марат Шемиунов исполняет ведущие и характерные партии в большинстве балетов, представленных в репертуаре Михайловского театра. В 2025 году он был удостоен почётного звания заслуженного артиста Санкт-Петербурга.